Stell mal die door bushings neu ein. Das sind quasi diese Dinger hier:
Door Bushings / Türführung B-Säule Mazda MX-5 ND / ABARTH /Fiat 124 Spider - ZYMEXX Fahrzeugtechnik GmbH
Door Bushings / Türführung B-Säule Mazda MX-5 ND & Fiat Spider 124
zymexx.de
Löse sie, ziehe sie in Richtung oben und außen (sodass er in höchster und äußerster Position ist), ziehe ihn leicht fest (sodass er zwar in Position bleibt, aber mit etwas Kraft wieder verschoben werden kann) und schließe einmal die Tür. Der Klotz setzt sich dadurch in die richtige Position.
Danach kannst du die Schrauben wieder festziehen (nicht übertreiben, nach fest kommt ab)