Ich hatte neulich auch ein Quietschen beim Betätigen des Kupplungspedals. Ich habe es einfach mal auf eine Manschette/das Ausrücklager geschoben und mir nicht weiter Gedanken darum gemacht und es auch mit auf das Wetter geschoben.
Ein hakeliger Gang im Zusammenhang mit Geräuschen würde mir auch "Sorgen" machen. Wenn dein Getriebe getauscht wird ist ja alles gut! Besser jetzt als außerhalb der Garantiezeit.